市农业局稳步推进规模畜禽场污染治理工作，将全市生猪存栏500头以上、奶牛50头以上养殖的47家企业，列入省“811”治理项目，将市区80家畜禽规模场列入市水环境整治项目。三区都建立了畜禽规模场治理责任制及治理项目联系卡，并建立了月报表制度。截至2007年底，累计投资870万元，在全市各县（市、区）建成沼气池8670立方米；在黄岩区与路桥区建成2个畜禽粪便收集处理中心项目，将畜禽粪便收集加工成有机肥。全市规模化畜禽养殖场排泄物治理工程提前完成。